鬼武者3的隱藏要素與前作一樣非常豐富,下面就公布一些隱藏要素供玩家挑戰。

    1.平八無賴傳：只要在任意難度下爆機就會出現，玩家可以使用平八郎——德川四天王之一本多忠勝進行一段游戲。

　　2.鬼射：以普通難度爆機就會出現的射擊游戲。

　　3.鬼修煉：取得游戲中所有鬼武道書，完成其中所有的修煉項目后出現。

　　4.Puzzle魔空空間：將游戲中的Puzzle寶箱全部開啟后便會出現此模式。

　　5.獲得最強裝備：只要將鬼射完成便會出現。在最強裝備模式下此模式下武器與防具能力全滿且彈藥無限。

　　6.熊貓裝獲得：只要通過鬼修煉模式就可以獲得,另外如果記錄卡中有《鬼武者—無賴轉》就可以直接獲得。

　　7.前作中的武器：如果在魔空間取得三個“封印玉”后爆機，那么在下次游戲時，左馬介在穿越時空時丟失的三把強力武器“紫電”“紅炎”與“白鳳”，便可在巴黎的小巷中找到和使用了。